球队身价2280万欧元
| 赛季 | 排名 | 胜 | 平 | 负 |
|---|---|---|---|---|
| 2024/2025 德乙 | 2 | 5 | 6 | 1 |
| 2023/2024 德乙 | 7 | 15 | 7 | 12 |
| 2022/2023 德乙 | 6 | 16 | 7 | 11 |
| 2021/2022 德乙 | 7 | 13 | 12 | 9 |
| 2020/2021 德乙 | 9 | 12 | 11 | 11 |
| 2019/2020 德甲 | 18 | 4 | 8 | 22 |
| 2018/2019 德乙 | 2 | 16 | 9 | 9 |
| 2017/2018 德丙联 | 2 | 25 | 8 | 5 |
| 2016/2017 德丙联 | 18 | 12 | 8 | 18 |
| 2015/2016 德乙 | 18 | 6 | 10 | 18 |
| 2014/2015 德甲 | 18 | 7 | 10 | 17 |
| 2013/2014 德乙 | 2 | 18 | 8 | 8 |
| 2012/2013 德乙 | 12 | 11 | 9 | 14 |
| 2011/2012 德乙 | 5 | 17 | 10 | 7 |
| 2010/2011 德乙 | 12 | 10 | 9 | 15 |
| 2009/2010 德乙 | 6 | 14 | 9 | 11 |
| 2008/2009 德丙联 | 3 | 20 | 8 | 10 |
| 2008/2009 德乙 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 2007/2008 德乙 | 17 | 6 | 13 | 15 |
| 2006/2007 德乙 | 11 | 11 | 9 | 14 |
帕德博恩足球俱乐部在1985年由“佩德伯恩足球俱乐部”（FC Paderborn）和“TuS Schloß 诺伊豪斯”（TuS Schloß Neuhaus）合并而成“TuS 佩德伯恩-诺伊豪斯”（TuS Paderborn-Neuhaus）。诺伊豪斯俱乐部成立于1907年，在1970年和当地的“TuS 1910 Sennelager”合并形成了“TuS Schloss 诺伊豪斯”（TuS Schloss Neuhaus）。诺伊豪斯和佩德伯恩长期游走于德国足球第三级联赛（德丙）。帕德博恩在2014年5月11日主场2-1战胜艾伦后锁定了德乙联赛第二名历史上第一次升入德甲联赛。
2014/2015赛季德甲联赛结束，升入德甲仅一年的帕德博恩排名倒数第一，只有接受降级，重回德乙。